Protein–RNA interactions for Protein: P07992

ERCC1, DNA excision repair protein ERCC-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC1P07992 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERCC1P07992 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC1P07992 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ERCC1P07992 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ERCC1P07992 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERCC1P07992 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms