Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNNC2P02585 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNC2P02585 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNC2P02585 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNC2P02585 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNC2P02585 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNC2P02585 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNC2P02585 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNNC2P02585 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNC2P02585 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNC2P02585 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNC2P02585 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNNC2P02585 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNC2P02585 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNC2P02585 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNC2P02585 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNC2P02585 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TNNC2P02585 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms