Protein–RNA interactions for Protein: O76009

KRT33A, Keratin, type I cuticular Ha3-I, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT33AO76009 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT33AO76009 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT33AO76009 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT33AO76009 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT33AO76009 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms