Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RRP9O43818 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP9O43818 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP9O43818 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RRP9O43818 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RRP9O43818 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP9O43818 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP9O43818 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RRP9O43818 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP9O43818 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP9O43818 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP9O43818 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP9O43818 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP9O43818 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RRP9O43818 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP9O43818 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP9O43818 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RRP9O43818 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP9O43818 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP9O43818 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RRP9O43818 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP9O43818 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP9O43818 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RRP9O43818 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP9O43818 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RRP9O43818 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP9O43818 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP9O43818 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP9O43818 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP9O43818 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RRP9O43818 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RRP9O43818 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP9O43818 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RRP9O43818 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP9O43818 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RRP9O43818 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RRP9O43818 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP9O43818 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP9O43818 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP9O43818 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RRP9O43818 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP9O43818 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RRP9O43818 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP9O43818 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP9O43818 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RRP9O43818 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP9O43818 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP9O43818 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP9O43818 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP9O43818 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RRP9O43818 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP9O43818 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP9O43818 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP9O43818 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RRP9O43818 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP9O43818 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RRP9O43818 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP9O43818 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RRP9O43818 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP9O43818 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP9O43818 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RRP9O43818 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP9O43818 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RRP9O43818 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RRP9O43818 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RRP9O43818 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP9O43818 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP9O43818 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP9O43818 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP9O43818 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP9O43818 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RRP9O43818 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
RRP9O43818 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RRP9O43818 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RRP9O43818 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP9O43818 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP9O43818 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RRP9O43818 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP9O43818 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP9O43818 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RRP9O43818 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RRP9O43818 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RRP9O43818 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP9O43818 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RRP9O43818 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RRP9O43818 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RRP9O43818 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP9O43818 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RRP9O43818 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP9O43818 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP9O43818 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RRP9O43818 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP9O43818 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP9O43818 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RRP9O43818 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP9O43818 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP9O43818 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP9O43818 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RRP9O43818 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RRP9O43818 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms