Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENRO43583 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DENRO43583 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENRO43583 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENRO43583 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENRO43583 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DENRO43583 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENRO43583 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENRO43583 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DENRO43583 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENRO43583 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENRO43583 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENRO43583 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DENRO43583 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENRO43583 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DENRO43583 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENRO43583 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENRO43583 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DENRO43583 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENRO43583 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENRO43583 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DENRO43583 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENRO43583 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DENRO43583 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENRO43583 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENRO43583 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENRO43583 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENRO43583 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENRO43583 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DENRO43583 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DENRO43583 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DENRO43583 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DENRO43583 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DENRO43583 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DENRO43583 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DENRO43583 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DENRO43583 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DENRO43583 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DENRO43583 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
DENRO43583 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DENRO43583 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DENRO43583 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DENRO43583 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DENRO43583 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DENRO43583 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DENRO43583 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DENRO43583 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DENRO43583 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DENRO43583 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DENRO43583 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DENRO43583 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DENRO43583 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DENRO43583 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DENRO43583 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DENRO43583 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DENRO43583 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DENRO43583 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DENRO43583 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENRO43583 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENRO43583 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DENRO43583 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENRO43583 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DENRO43583 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENRO43583 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENRO43583 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DENRO43583 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DENRO43583 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENRO43583 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENRO43583 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENRO43583 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DENRO43583 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENRO43583 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENRO43583 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENRO43583 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENRO43583 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENRO43583 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENRO43583 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DENRO43583 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENRO43583 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENRO43583 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENRO43583 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENRO43583 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DENRO43583 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENRO43583 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENRO43583 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENRO43583 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENRO43583 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DENRO43583 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENRO43583 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENRO43583 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENRO43583 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DENRO43583 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENRO43583 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENRO43583 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENRO43583 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENRO43583 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DENRO43583 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENRO43583 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DENRO43583 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DENRO43583 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms