Protein–RNA interactions for Protein: O15234

CASC3, Protein CASC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3O15234 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CASC3O15234 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASC3O15234 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASC3O15234 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASC3O15234 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASC3O15234 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASC3O15234 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASC3O15234 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASC3O15234 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASC3O15234 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASC3O15234 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASC3O15234 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASC3O15234 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASC3O15234 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CASC3O15234 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASC3O15234 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASC3O15234 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASC3O15234 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASC3O15234 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASC3O15234 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASC3O15234 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CASC3O15234 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASC3O15234 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASC3O15234 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASC3O15234 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CASC3O15234 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC3O15234 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASC3O15234 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASC3O15234 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASC3O15234 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASC3O15234 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC3O15234 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC3O15234 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC3O15234 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CASC3O15234 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CASC3O15234 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC3O15234 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC3O15234 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC3O15234 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC3O15234 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC3O15234 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CASC3O15234 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC3O15234 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC3O15234 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CASC3O15234 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC3O15234 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC3O15234 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC3O15234 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CASC3O15234 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC3O15234 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC3O15234 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CASC3O15234 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASC3O15234 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CASC3O15234 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASC3O15234 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASC3O15234 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASC3O15234 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASC3O15234 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CASC3O15234 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CASC3O15234 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CASC3O15234 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASC3O15234 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASC3O15234 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASC3O15234 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASC3O15234 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CASC3O15234 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC3O15234 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC3O15234 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC3O15234 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC3O15234 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CASC3O15234 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC3O15234 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC3O15234 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC3O15234 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CASC3O15234 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC3O15234 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CASC3O15234 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC3O15234 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC3O15234 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CASC3O15234 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC3O15234 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CASC3O15234 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CASC3O15234 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC3O15234 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC3O15234 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC3O15234 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC3O15234 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC3O15234 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CASC3O15234 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC3O15234 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms