Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TO15178 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TO15178 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TO15178 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TO15178 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TO15178 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TO15178 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TO15178 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TO15178 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TO15178 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TO15178 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TO15178 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TO15178 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TO15178 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TO15178 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TO15178 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TO15178 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TO15178 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TO15178 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TO15178 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TO15178 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TO15178 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TO15178 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TO15178 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TO15178 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TO15178 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TO15178 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TO15178 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TO15178 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TO15178 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TO15178 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TO15178 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TO15178 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TO15178 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TO15178 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TO15178 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TO15178 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TO15178 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TO15178 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TO15178 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TO15178 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TO15178 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TO15178 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TO15178 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TO15178 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TO15178 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TO15178 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TO15178 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TO15178 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TO15178 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TO15178 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TO15178 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TO15178 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TO15178 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TO15178 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TO15178 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TO15178 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TO15178 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TO15178 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TO15178 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TO15178 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TO15178 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TO15178 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TO15178 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TO15178 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TO15178 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TO15178 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TO15178 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TO15178 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TO15178 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TO15178 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TO15178 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TO15178 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TO15178 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TO15178 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TO15178 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TO15178 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TO15178 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TO15178 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TO15178 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TO15178 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TO15178 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TO15178 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TO15178 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TO15178 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TO15178 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TO15178 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms