Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASKO14936 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CASKO14936 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKO14936 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKO14936 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASKO14936 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASKO14936 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKO14936 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKO14936 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASKO14936 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKO14936 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKO14936 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKO14936 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKO14936 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKO14936 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKO14936 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CASKO14936 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKO14936 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKO14936 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKO14936 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CASKO14936 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKO14936 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKO14936 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CASKO14936 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKO14936 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKO14936 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CASKO14936 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKO14936 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKO14936 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKO14936 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKO14936 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CASKO14936 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKO14936 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKO14936 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKO14936 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKO14936 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKO14936 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKO14936 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKO14936 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKO14936 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CASKO14936 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CASKO14936 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKO14936 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKO14936 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKO14936 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKO14936 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKO14936 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKO14936 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASKO14936 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKO14936 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKO14936 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASKO14936 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKO14936 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKO14936 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKO14936 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKO14936 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKO14936 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASKO14936 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKO14936 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKO14936 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASKO14936 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKO14936 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKO14936 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASKO14936 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKO14936 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKO14936 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKO14936 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKO14936 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKO14936 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASKO14936 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKO14936 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKO14936 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASKO14936 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKO14936 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CASKO14936 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKO14936 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKO14936 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CASKO14936 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKO14936 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKO14936 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKO14936 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKO14936 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CASKO14936 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKO14936 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKO14936 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKO14936 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKO14936 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKO14936 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CASKO14936 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKO14936 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKO14936 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKO14936 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKO14936 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CASKO14936 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKO14936 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKO14936 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKO14936 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKO14936 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKO14936 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CASKO14936 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms