Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TOR1AO14656 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TOR1AO14656 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TOR1AO14656 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TOR1AO14656 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms