Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HMGB1P1B2RPK0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HMGB1P1B2RPK0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HMGB1P1B2RPK0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HMGB1P1B2RPK0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HMGB1P1B2RPK0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms