Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LINC00587B1AMM8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LINC00587B1AMM8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LINC00587B1AMM8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LINC00587B1AMM8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LINC00587B1AMM8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms