Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD3A6NKT7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
RGPD3A6NKT7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD3A6NKT7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RGPD3A6NKT7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD3A6NKT7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD3A6NKT7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RGPD3A6NKT7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.97
RGPD3A6NKT7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
RGPD3A6NKT7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD3A6NKT7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD3A6NKT7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD3A6NKT7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms