Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
A0A0J9YVX5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A0J9YVX5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A0A0J9YVX5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0J9YVX5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0J9YVX5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0J9YVX5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A0A0J9YVX5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0J9YVX5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0J9YVX5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0J9YVX5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A0A0J9YVX5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
A0A0J9YVX5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms