Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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ITGB3BPQ13352 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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ITGB3BPQ13352 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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ITGB3BPQ13352 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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ITGB3BPQ13352 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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ITGB3BPQ13352 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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ITGB3BPQ13352 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
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ITGB3BPQ13352 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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