Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SNORD91A-202ENST00000609620 191 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CRB1-202ENST00000367399 3885 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC01994-201ENST00000496220 1808 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CARF-212ENST00000434998 1955 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 WBP2NL-201ENST00000328823 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NME8-201ENST00000199447 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC01359-204ENST00000447748 2804 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 HMGXB4-201ENST00000216106 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NBPF15-206ENST00000581897 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PRKAR2A-AS1-202ENST00000416209 3447 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 DDX42-203ENST00000457800 3323 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC02208-201ENST00000506769 2803 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL359396.1-201ENST00000623151 2376 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 IL1RAP-213ENST00000447382 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC01630-208ENST00000635680 4363 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MIR99A-201ENST00000384906 81 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC097468.2-201ENST00000429343 553 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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CLN3Q13286 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC092718.4-201ENST00000566639 716 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AC010327.2-201ENST00000587647 488 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 FAM13A-AS1_2.1-201ENST00000611121 108 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 OR2H2-202ENST00000641840 3061 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SLC6A16-202ENST00000454748 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 MFSD6-201ENST00000281416 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CLN3Q13286 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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