Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
TRIM28Q13263 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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