Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TAB2-AS1-201ENST00000424421 730 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
DUSP4Q13115 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
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