Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 RGPD1-206ENST00000641458 5271 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SRRTQ9BXP5 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms