Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PDGFRLQ15198 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PDGFRLQ15198 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms