Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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