Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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