Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 PPIAL4C-201ENST00000585245 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 DCLRE1B-201ENST00000369563 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 MLLT3-203ENST00000380338 6772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 CPNE4-210ENST00000512332 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
TRHP20396 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 SMCO1-201ENST00000397537 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 GOSR2-221ENST00000638892 3808 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 PRCP-202ENST00000393399 2120 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 GSTA10P-201ENST00000412182 576 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 AL589990.1-201ENST00000432210 592 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 PPP1R8P1-201ENST00000452549 1044 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 IGKV2-29-201ENST00000521304 372 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 MOV10L1-209ENST00000540615 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 MAP3K13-203ENST00000424227 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 ARHGAP32-202ENST00000392657 6556 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 MICAL3-219ENST00000585038 3323 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 ATF2-203ENST00000392544 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 GABRA1-203ENST00000428797 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 ZFP90-201ENST00000398253 4384 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC104083.1-201ENST00000569449 2615 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 LRRC2-202ENST00000395905 5100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 SLC9A9-201ENST00000316549 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 OAT-201ENST00000368845 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 TMX2-202ENST00000378312 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC093768.1-201ENST00000505987 2173 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
TRHP20396 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms