Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
PTPRAP18433 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 HTR1D-201ENST00000374619 2835 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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PTPRAP18433 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PTPRAP18433 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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