Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RSPO3-202ENST00000368317 1290 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 S100A7-202ENST00000368723 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL158214.1-201ENST00000444423 404 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC027796.1-201ENST00000575593 512 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RN7SKP39-201ENST00000410773 322 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC006509.1-201ENST00000420788 634 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AF196972.1-201ENST00000445586 653 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC073648.3-201ENST00000504939 925 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
LINC00587B1AMM8 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms