Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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CCDC96Q2M329 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC96Q2M329 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC96Q2M329 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC96Q2M329 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CCDC96Q2M329 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC96Q2M329 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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