Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CENPFP49454 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CENPFP49454 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CENPFP49454 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms