Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SYTL2-220ENST00000529581 1910 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZNF19-210ENST00000567225 2838 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RNU4-59P-201ENST00000364447 116 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 FKBP1AP3-201ENST00000423650 319 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 TRMT112P4-201ENST00000429016 379 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RN7SL359P-201ENST00000473502 288 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LINC00544-202ENST00000481738 575 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 KRTDAP-203ENST00000484218 451 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RPL27A-204ENST00000526562 519 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 STX8P1-201ENST00000603161 355 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 OR11A1-203ENST00000377149 2611 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 ZBTB37-204ENST00000427304 2300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 MCOLN3-203ENST00000370589 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PTPN20-205ENST00000395721 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PPFIBP2-224ENST00000533792 3003 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ATP8A2-201ENST00000255283 3287 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 MAN1A2P1-201ENST00000590286 1400 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RTL1-201ENST00000534062 4193 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 PPP6R3-203ENST00000393800 5093 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZIC4-201ENST00000383075 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 KDM2B-206ENST00000538046 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 FRMPD2-202ENST00000374201 4997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CATSPERG-204ENST00000410018 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ACAN-203ENST00000558207 4159 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LDAH-201ENST00000237822 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 BACH2-202ENST00000343122 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
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