Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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TRAF1Q13077 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TRAF1Q13077 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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