Protein–RNA interactions for Protein: C9JFL3

PHGR1, Proline, histidine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGR1C9JFL3 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 WDCP-202ENST00000406895 3700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 MAPK6-201ENST00000261845 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
PHGR1C9JFL3 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms