Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 COL12A1-201ENST00000322507 11723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC00963-202ENST00000419300 9557 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 IGFN1-202ENST00000335211 11810 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF462-204ENST00000441147 4691 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DTHD1-201ENST00000357504 3203 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MYO5C-201ENST00000261839 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TENM2-205ENST00000519204 9427 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ITK-201ENST00000422843 4528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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