Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CACNA1SQ13698 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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