Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR7

KRTAP3-2, Keratin-associated protein 3-2, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-2Q9BYR7 ZFAND5-201ENST00000237937 5310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 DCLK3-203ENST00000636136 5446 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 FOXN1-201ENST00000226247 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ZNF215-201ENST00000278319 3448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 SF3B2-201ENST00000322535 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RASGRP4-202ENST00000426920 2650 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RASGRP4-220ENST00000622174 2651 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AL117258.1-201ENST00000637218 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 CD28-202ENST00000374481 4526 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 CADM2-201ENST00000383699 9488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RBM20-201ENST00000369519 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 VDR-206ENST00000549336 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ACSL6-203ENST00000379240 2548 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ZMYND11-205ENST00000381607 3898 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ARHGEF3-201ENST00000296315 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 FARSB-201ENST00000281828 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 PIPSL-201ENST00000480546 3350 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 TARS2P1-201ENST00000506124 2041 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 EFNB2-201ENST00000245323 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 TYRP1-203ENST00000388918 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC100788.2-201ENST00000625199 2889 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC245297.1-201ENST00000313342 933 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RIMKLBP1-201ENST00000408914 1164 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 MRPS21P6-201ENST00000415184 261 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 SWI5-203ENST00000418976 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 PHKG1P4-201ENST00000430144 370 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 SFTPA3P-201ENST00000446429 367 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 LINC00963-207ENST00000454635 910 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RN7SL743P-201ENST00000475032 298 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC090311.1-201ENST00000490739 249 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC025752.1-201ENST00000503317 558 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ZBED3-AS1-206ENST00000508401 582 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RACK1-226ENST00000511900 922 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC026904.4-201ENST00000523038 559 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ITFG2-AS1-204ENST00000547834 411 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 NDUFA6-AS1-208ENST00000600968 662 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ZNF417-201ENST00000312026 3597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 C5orf56-201ENST00000337752 4767 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 FRMPD2-202ENST00000374201 4997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 GOLGA6A-201ENST00000290438 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ZSCAN31-214ENST00000446474 2562 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 EFHC1-214ENST00000636107 3530 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 ITGAE-201ENST00000263087 3858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 SLC22A11-201ENST00000301891 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 KRT80-201ENST00000313234 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 RUFY2-213ENST00000602465 3863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 CEP44-204ENST00000457424 3290 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 SCN5A-207ENST00000449557 5898 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 TRPV3-211ENST00000616411 5742 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 CLIP1-213ENST00000540338 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 KDM5D-201ENST00000317961 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 FPGT-TNNI3K-206ENST00000557284 2855 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 NASP-201ENST00000350030 3207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC009336.3-201ENST00000623777 2620 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 KIAA0825-201ENST00000329378 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 SLC16A7-216ENST00000552432 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 DCX-210ENST00000637453 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 DLST-202ENST00000334220 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 EXOSC10-202ENST00000376936 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 MYL6B-211ENST00000553066 1305 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
KRTAP3-2Q9BYR7 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.6 ms