Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 PALB2-201ENST00000261584 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC139495.3-201ENST00000515156 4437 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ADAMTS12-201ENST00000352040 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 TP53BP1-203ENST00000382044 10384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 TYW1-207ENST00000615572 3156 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 SF3B1-211ENST00000487698 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 SKAP1-201ENST00000336915 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 NXPE2-201ENST00000389586 1873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 MYH2-201ENST00000245503 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 SLC8A1-205ENST00000405901 3139 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 STAT6-201ENST00000300134 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 SLC16A4-203ENST00000437429 2372 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 MORF4L2-201ENST00000360458 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC239860.1-201ENST00000444680 1270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC105393.1-202ENST00000449621 598 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 PSMB3P2-201ENST00000457237 618 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC123768.1-202ENST00000460684 461 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 RPL23AP66-201ENST00000494341 479 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC120498.4-201ENST00000561649 320 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC091132.5-201ENST00000590995 560 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC025518.2-201ENST00000605229 492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ARHGEF9-201ENST00000253401 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 APOBEC4-201ENST00000308641 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 NYAP2-201ENST00000272907 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 GIGYF2-205ENST00000409547 5978 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 SLC19A3-201ENST00000258403 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 TP63-202ENST00000320472 2032 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 EFHC1-213ENST00000635996 2548 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 TMEM39A-201ENST00000319172 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 CD163L1-202ENST00000416109 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 SYNPR-212ENST00000479198 2436 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 PABPC1L-203ENST00000217075 670 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 OR1G1-201ENST00000328890 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC104699.1-201ENST00000352271 414 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 RNA5SP69-201ENST00000364477 117 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 RIMKLBP1-201ENST00000408914 1164 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AGBL5-IT1-201ENST00000411862 339 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ARAFP3-201ENST00000454154 490 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL749P-201ENST00000460421 290 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 WBP1LP2-201ENST00000515260 998 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL133371.3-201ENST00000556197 549 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 LINC01255-203ENST00000587189 591 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 MIR7156-201ENST00000620979 60 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 PAMR1-207ENST00000619888 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ZNF728-201ENST00000594710 2015 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 MSL3-202ENST00000337339 3446 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 MTF2-214ENST00000545708 4046 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 LIAS-222ENST00000640888 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 FAM19A2-211ENST00000550003 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ZNF443-201ENST00000301547 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 KCNMA1-AS1-206ENST00000600782 1755 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms