Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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