Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC02128-205ENST00000641755 1334 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MIER1-201ENST00000355356 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ZDBF2-201ENST00000374423 10286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF215-202ENST00000414517 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF35-202ENST00000396056 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL137145.2-201ENST00000399868 3086 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 USP16-204ENST00000399976 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LGALS8-202ENST00000323938 1855 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 XRCC5-202ENST00000392133 3761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 OR2T10-202ENST00000642090 3519 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 PDE4DIP-204ENST00000369351 4922 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 EPHA4-201ENST00000281821 6346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 SNRK-AS1-201ENST00000422681 750 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 SNX18P3-201ENST00000424993 835 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL161454.1-201ENST00000446226 569 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 TUBBP11-201ENST00000472255 252 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RPL21P42-201ENST00000488408 464 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC087257.2-201ENST00000538759 928 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CYP2C8-213ENST00000628935 924 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RSPO2-203ENST00000517939 2487 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC127459.1-201ENST00000563129 2768 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC026124.1-201ENST00000545709 3457 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 SNX25-207ENST00000618785 3151 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LIG4-204ENST00000611712 4180 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 WISP3-202ENST00000361714 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms