Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC106732.1-201ENST00000512458 550 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 TEX41-210ENST00000451774 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
TRAM2Q15035 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194 ms