Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SH3BGRP55822 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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