Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NXPE3-203ENST00000477909 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC023245.2-201ENST00000530760 2978 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PABPC1P1-201ENST00000506347 591 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms