Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
HERC1Q15751 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NFIB-218ENST00000636432 1953 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 UNC5C-201ENST00000453304 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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HERC1Q15751 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 HDAC2-205ENST00000519065 9874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 VLDLR-203ENST00000382100 9163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MAP3K9-207ENST00000611979 10497 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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