Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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COL24A1Q17RW2 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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COL24A1Q17RW2 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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COL24A1Q17RW2 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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COL24A1Q17RW2 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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COL24A1Q17RW2 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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COL24A1Q17RW2 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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COL24A1Q17RW2 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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COL24A1Q17RW2 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
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COL24A1Q17RW2 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
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COL24A1Q17RW2 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
COL24A1Q17RW2 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
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