Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A4Q9Y6R1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC4A4Q9Y6R1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms