Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GPC6Q9Y625 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms