Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP16Q9Y5T5 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms