Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL4A3BPQ9Y5P4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms