Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NRXN3Q9Y4C0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NRXN3Q9Y4C0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms