Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RHBDD3Q9Y3P4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RHBDD3Q9Y3P4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms