Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNIP3Q9Y2W7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KCNIP3Q9Y2W7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms