Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3M1Q9Y2T2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms