Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF13BQ9Y275 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF13BQ9Y275 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms