Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMC3Q9UQE7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMC3Q9UQE7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms